ในสมัยอยุธยาเป็นราชธานี สมเด็จพะโค๊ะเจ้า ได้เสด็จจาริกธุดงค์ และมาปักกรด ณ วัดแห่งหนึ่ง ณ เมืองอลอง (ต.ฉลอง อ.สิชล จ.นครศรีธรรมราช ในปัจจุบัน) ซึ่งตามบันทึกของประวัติเมืองอลอง (ALONG) (ชื่อตามแผนที่เดินเรือสินค้าของโปรตุเกตได้บันทึกไว้) เมื่อพระสมเด็จเสด็จออกจากวัดไป ทางชาวบ้านละแวกนี้ ได้สร้างเจดีย์ครอบที่ปักกรดเอาไว้เพื่อสักการะบูชา และได้เรียกขานวัดแห่งนี้ว่าวัดโพธิ์เสด็จ และชุมชนโพธิ์เสด็จ ตามนิมิตหมายที่ดีว่ามีสมเด็จพะโค๊ะเจ้า ซึ่งเชื่อกันว่าเป็นพระโพธิ์สัตว์เสด็จมา

ตามบันทึกเมืองอลอง ใช้เป็นสถานที่ถือน้ำพิพัฒน์สัตยาของเจ้าเมืองอลองก่อนขึ้นครองเมือง โดยมีน้ำจากบ่อน้ำศักดิ์สิทธิ์ของเมืองอลอง 5 บ่อ 1.บ่อน้ำวัดโพธิ์ ( วัดเจดีย์) 2.บ่อน้ำวัดพระโอน 3.บ่อน้ำนาคราช 4.บ่อน้ำสระเจ้าแม่อ่างทอง 5.บ่อน้ำตึกกุลา โดยมีเจ้าเมืองนครนำน้ำอันศักดิ์ มาผสมอีก 6 บ่อ 1 บ่อน้ำวัดเสมาเมือง 2. บ่อน้ำวัดเสมาชัย 3. บ่อน้ำวัดประตูขาว 4. บ่อน้ำเขามหาชัย 5. บ่อน้ำปากนาคราช 6 บ่อน้ำวัดพระลาน และมีเจ้าเมืองนครเป็นประธานพิธี และวัดโพธิ์เสด็จได้มาร้างอีกครั้งในสมัยสงคราม 9 ทัพ